A inicios de la decada de 1990 fue promotora de salud de la Asociacion Indigena del Cauca (AIC), donde su liderazgo se consolido tras la tragedia de 1994 en Tierradentro, donde un sismo y una avalancha afectaron gravemente a su comunidad. Esta catastrofe llevo a una reorganizacion de su pueblo, momento en el cual Quilcue comenzo su labor como maestra comunitaria.
En el ano 2000 fue coordinadora del programa de salud en la AIC y en el Consejo Regional Indigena del Cauca (CRIC). Entre los anos 2003 y 2009 fue nombrada consejera mayor del Consejo Regional Indigena del Cauca, siendo coorganizadora de la Minga Indigena del 2008, en la que participaron miles de indigenas que marcharon hacia Bogota en protesta.
En dicha movilizacion fallecio su esposo Edwin Legarda el 16 de diciembre en un retén militar en la carretera que conduce a Inza (Cauca), tras recibir disparos por soldados del Ejercito. Durante el juicio y en los anos posteriores, Quilcue y su hija han sido victimas de amenazas de muerte y hostigamientos.
